手性色谱柱是将具有光学活性的单体固定在硅胶或其它聚合物上所制成手性固定相。通过引入手性环境使对映异构体间呈现物理特征的差异，从而达到光学异构体拆分的目的。
根据手性固定相和溶剂的相互作用机制，Irving Wainer提出了手性色谱柱的分类体系：
1、通过氢键、π-π作用、偶极-偶极作用形成复合物。
2、既有类型1中的相互作用，又存在包埋复合物。此类手性色谱柱中典型的是由纤维素及其衍生物制成的手性色谱柱。
3、基于溶剂进入手性空穴形成包埋复合物。这类手性色谱柱中最典型的是由Armstrong教授开发的环糊精型手性柱[2]，另外冠醚型手性柱和螺旋型聚合物，如聚（苯基甲基甲基丙烯酸酯）形成的手性色谱柱也属于此类。
4、基于形成非对映体的金属络合物，是由Davankov开发的手性分离技术，也称为手性配位交换色谱（CLEC）。
5、蛋白质型手性色谱柱。手性分离是基于疏水相互作用和极性相互作用实现。
但是，随着由于市场上可选择的手性色谱柱越来越多，此分类系统有时很难将一些手性柱归纳进去。因此参考Irving Wainer的分类方法，根据固定相的化学结构，将手性色谱柱分为以下几种：
刷（Brush）型或称为Prikle型
纤维素（Cellulose）型
环糊精（Cyclodextrin）型
大环抗生素（Macrocyclicantibiotics）型
蛋白质（Protein）型
配位交换（|Ligandexchange）型
冠醚（Crown ethers）型
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